MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10C

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017649	T	7	7	27	33	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017649	A	6	6	61	66	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017649	GGT	2	6	78	83	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017649	T	6	6	83	88	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017649	CAG	2	6	138	143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017649	GCT	2	6	253	258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017649	G	6	6	339	344	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017649	CA	3	6	351	356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017649	G	6	6	586	591	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017649	GCG	2	6	614	619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017649	CGC	2	6	726	731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017649	CTG	2	6	968	973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017649	TCG	2	6	1116	1121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017649	AGT	2	6	1146	1151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017649	TGT	3	9	1197	1205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017649	GTT	2	6	1219	1224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017649	G	6	6	1245	1250	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017649	GGT	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017649	TCCTG	2	10	1307	1316	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017649	ATAA	2	8	1354	1361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017649	TGCAG	2	10	1368	1377	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017649	AAT	2	6	1423	1428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017649	TGT	2	6	1526	1531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017649	AT	3	6	1545	1550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017649	CGT	2	6	1578	1583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017649	CGA	2	6	1584	1589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017649	A	6	6	1644	1649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017649	TTAA	2	8	1653	1660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017649	T	7	7	1690	1696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017649	GCT	2	6	1716	1721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017649	A	6	6	1894	1899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017649	G	6	6	1985	1990	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017649	T	6	6	2054	2059	0 %	100 %	0 %	0 %	386622391
34	NC_017649	ATA	2	6	2134	2139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386622391
35	NC_017649	TAAA	2	8	2282	2289	75 %	25 %	0 %	0 %	386622391
36	NC_017649	GCT	2	6	2311	2316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622391
37	NC_017649	TATT	2	8	2371	2378	25 %	75 %	0 %	0 %	386622391
38	NC_017649	TTGTTT	2	12	2411	2422	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386622391
39	NC_017649	TTA	2	6	2470	2475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622391
40	NC_017649	CT	3	6	2496	2501	0 %	50 %	0 %	50 %	386622391
41	NC_017649	AATTC	2	10	2555	2564	40 %	40 %	0 %	20 %	386622391
42	NC_017649	GT	3	6	2570	2575	0 %	50 %	50 %	0 %	386622391
43	NC_017649	T	6	6	2575	2580	0 %	100 %	0 %	0 %	386622391
44	NC_017649	ATT	2	6	2581	2586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622391
45	NC_017649	T	6	6	2620	2625	0 %	100 %	0 %	0 %	386622391
46	NC_017649	A	6	6	2638	2643	100 %	0 %	0 %	0 %	386622391
47	NC_017649	T	8	8	2652	2659	0 %	100 %	0 %	0 %	386622391
48	NC_017649	TAT	2	6	2664	2669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622391
49	NC_017649	A	6	6	2682	2687	100 %	0 %	0 %	0 %	386622391
50	NC_017649	T	6	6	2715	2720	0 %	100 %	0 %	0 %	386622391
51	NC_017649	GA	3	6	2732	2737	50 %	0 %	50 %	0 %	386622391
52	NC_017649	A	6	6	2876	2881	100 %	0 %	0 %	0 %	386622391
53	NC_017649	TGA	2	6	2902	2907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622391
54	NC_017649	AAAT	2	8	2937	2944	75 %	25 %	0 %	0 %	386622391
55	NC_017649	GTT	2	6	2970	2975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386622391
56	NC_017649	GGT	2	6	2983	2988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386622391
57	NC_017649	GT	3	6	2987	2992	0 %	50 %	50 %	0 %	386622391
58	NC_017649	TCT	2	6	3054	3059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386622391
59	NC_017649	T	6	6	3134	3139	0 %	100 %	0 %	0 %	386622391
60	NC_017649	TTG	2	6	3146	3151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386622391
61	NC_017649	CATG	2	8	3168	3175	25 %	25 %	25 %	25 %	386622391
62	NC_017649	A	6	6	3244	3249	100 %	0 %	0 %	0 %	386622392
63	NC_017649	T	6	6	3274	3279	0 %	100 %	0 %	0 %	386622392
64	NC_017649	AG	3	6	3324	3329	50 %	0 %	50 %	0 %	386622392
65	NC_017649	TTA	2	6	3341	3346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622392
66	NC_017649	A	7	7	3395	3401	100 %	0 %	0 %	0 %	386622392
67	NC_017649	ATT	2	6	3407	3412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622392
68	NC_017649	T	6	6	3411	3416	0 %	100 %	0 %	0 %	386622392
69	NC_017649	AAT	2	6	3418	3423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386622392
70	NC_017649	AT	3	6	3432	3437	50 %	50 %	0 %	0 %	386622392
71	NC_017649	A	6	6	3450	3455	100 %	0 %	0 %	0 %	386622392
72	NC_017649	CAA	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386622392
73	NC_017649	TGA	2	6	3519	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622392
74	NC_017649	AGAA	2	8	3525	3532	75 %	0 %	25 %	0 %	386622392
75	NC_017649	ATG	2	6	3551	3556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622392
76	NC_017649	AC	3	6	3586	3591	50 %	0 %	0 %	50 %	386622392
77	NC_017649	AT	3	6	3592	3597	50 %	50 %	0 %	0 %	386622392
78	NC_017649	GCAGG	2	10	3632	3641	20 %	0 %	60 %	20 %	386622392
79	NC_017649	ATG	2	6	3673	3678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622392
80	NC_017649	T	6	6	3724	3729	0 %	100 %	0 %	0 %	386622392
81	NC_017649	A	7	7	3731	3737	100 %	0 %	0 %	0 %	386622392
82	NC_017649	AAC	2	6	3825	3830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386622392
83	NC_017649	AAG	2	6	3848	3853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386622392
84	NC_017649	GAT	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622392
85	NC_017649	GAG	2	6	3922	3927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386622392
86	NC_017649	AATA	2	8	3930	3937	75 %	25 %	0 %	0 %	386622392
87	NC_017649	ACG	2	6	3967	3972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386622392
88	NC_017649	ATA	3	9	4001	4009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386622392
89	NC_017649	TCAG	2	8	4035	4042	25 %	25 %	25 %	25 %	386622392
90	NC_017649	AAT	2	6	4066	4071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386622392
91	NC_017649	TGT	2	6	4152	4157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386622392
92	NC_017649	ATT	2	6	4160	4165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622392

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.